原因很复杂。
明侦选嘉宾一向有三大要求：逻辑推理、角色扮演（入戏）、综艺感（在入戏/出戏、严肃/搞笑之间反复横跳）。新来的嘉宾至少要占其中两项，才能保证节目的基本效果。
现状题主也说了，“从第五季开始包括第六季三期大部分案件只有一位女嘉宾了，有两位女嘉宾的案子就是鬼和鸥”。（其实还有蓉戚、蓉昕。）
明侦豆瓣小组也有伙伴统计过：
只来了一期的嘉宾中，女嘉宾只有35%，说明初邀率低；来了两期的女嘉宾36%，复邀率与初邀率基本一致；来了三期及以上的女嘉宾25%，活跃阵容含女量低。
其中的原因，总结了一下有这几个因素，且相互之间有交互作用：
1、观众对女嘉宾的要求更高。
除了三大要求之外，女嘉宾还需要颜值高、声音好听、能对其他嘉宾（可能带点颜色）的玩笑应对自如、不能太抢戏也不能太没有存在感……当初杨蓉刚参加的时候，就因为声音和语速的原因被骂，我事后知道这事也是震惊于观众对女嘉宾的苛刻。当然，这也是当前各行各业都面临的情况，冰冻三尺非一日之寒，娱乐圈只是把这种现象放得更大了而已。
2、参加明侦对女嘉宾来说“性价比”并不高。
娱乐圈中，“智商高”“擅长推理”并不会成为女艺人的优势，但会极大地给男艺人加分。所以，从入口关来说，符合这一条要求的女艺人就比男艺人少（注意，这里只是说选拔艺人的时候的标准有偏好，而不是说男女智商有差异）。从宣传推广角度来说，参加明侦塑造“聪明”的形象，对女艺人来说也不会有很大增益，反而可能会引发反感或翻车。
再加上第一条，女艺人更可能因为种种意想不到的问题而被骂，所以女艺人团队在面对明侦的邀约时，顾虑会更多。
3、剧本设置原因，容易把女角色工具化或边缘化。
截止到明侦第六集第四期，所有的故事里最多只会出现1/3的女性角色，并且很多期的女性角色都是作为男性角色的配偶/爱慕对象等，承担丰富人物感情线的功能，对整个推理故事的逻辑链条起到的作用很小，很容易在第一次集中讨论或者第二次搜证时就被排除嫌疑或锁定目标。
当然也有例外，比如第三季《又冲不上的云霄》里的鬼维修和第五季《MGQ》里的蓉美妆，拥有独立丰富而逻辑自洽的故事线，可以作为未来编写女性角色时的参考标准。
第六季前四期，只有首发两期的蓉算是人设和故事很丰富，戚茶还算好但有点游离于核心故事之外，郭美妆就还是承担的感情线和讲故事的功能。
4、强势的女嘉宾，在明侦当前的剪辑和氛围下不容易出彩。
看过明侦的观众都知道，要想在节目中出彩，在三大基本要求之外，还需要有很强的表达能力和说服能力，才能“带节奏”或“归票”。然而，由于社会对男女要求的不同，敢于发声的女性本来就不如“普通且自信”的习惯mansplain的男性多，而强势输出的女艺人往往会面临大众舆论的反扑。比如杨蓉第二季刚参加时，就因为输出逻辑观点时“比较强势”而获得了一些负面评论。这就在很大程度上抑制了女嘉宾在明侦“出彩”的通路。所幸最近一段时间，女性发声的大环境有所好转，虽然还不够好，但也是好的趋势。希望明侦节目组也能看到这个趋势。
5、游戏机制原因：第六季双侦探七人局模式，叠加女嘉宾储备不足。
第六季当前已知的素人侦探都是男性，所以双北常驻再加上男素人，就已经锁死3/7的人是男性了。即使在女嘉宾频次不变的情况下，都必然导致女嘉宾的比例比前五季进一步下降。而看看两位第一季的常驻女嘉宾，鬼鬼由于疫情原因已确定无法参加，王鸥也由于拍戏+参加浪姐2而来不了几期。
在前4条因素叠加了五季的作用下，明侦积累下来的得到观众认可的女嘉宾屈指可数。现在恶果已现，就算本季重点开发新女嘉宾（事实上也是这样做的，新开发了郭采洁和金靖），也不可能一下就请很多期。与之对照的是男嘉宾，在观众比较宽容的情况下，可选项丰富多了。于是，就出现了第六季女嘉宾只占1/7的现状，比例缩减就更明显了。
总结一下，希望节目组能看到第六季以来很多观众在这方面发表的评论，在剧本设置、节目机制、嘉宾邀请、舆论引导方面，给女嘉宾更多的空间和机会。不只是女嘉宾，其实双侦探也完全可以挖掘一些女性的素人，这样观众的观感也能好一些。
至少，在类似于蓉门童这种动情的直面故事主题的时刻，如果有一个同性可以握手或者拥抱安慰一下，会比由蒲说“我们去买包”来破梗，起到的效果更好。
最不济，至少搜身也方便一点啊。